次世代定序癌症77基因檢測 (77 NGS Somatic Mutations in Cancer)

採用「次世代定序(NGS)癌症77基因檢測」的原因,主要可以從臨床、技術和個人化醫療三個層面來說明:

 

臨床上的意義

1.全面性檢測多種致癌基因

  • 癌症發生和進展涉及多種致癌基因與抑癌基因的突變、放大、融合等。一次檢測77個臨床相關的癌症基因,可以涵蓋最常見與具有臨床意義的突變,大幅提升檢出率。
  • 涵蓋如 EGFR, KRAS, BRAF, PIK3CA, ALK, ROS1, TP53, BRCA1/2 等,對多種癌症(肺癌、大腸癌、乳癌、卵巢癌等)都有臨床指導價值。

2.治療指引

  • 檢測結果可指引是否適合標靶治療或免疫治療,避免無效或毒性過高的治療。
  • 例如:檢出 EGFR 突變的肺癌病人可使用 EGFR TKI,檢出 BRCA 突變的乳/卵巢癌病人可考慮 PARP 抑制劑。

3.預後評估和監測

  • 部分基因突變和患者預後密切相關,如 TP53 突變常提示不良預後。
  • 部分基因有助於監測復發風險。

 

技術上的優勢

1.一次性高通量分析: 相較於傳統的 Sanger 定序或單基因檢測,NGS 可以一次性同時分析數十甚至數百個基因,提高效率並節省時間。
2.檢出敏感度高: 對低頻率的突變有較好的檢出能力,有利於檢測腫瘤組織樣本中少量突變細胞。
3.檢體需求少: 組織量有限(如肺癌活檢)時,NGS 的高通量和高效率能充分利用有限樣本。

 

個人化醫療趨勢

1.精準醫療基礎: 77基因檢測是基因組學指引精準醫療的具體實踐。不同患者腫瘤的分子特徵不同,需要個別化診療計畫。
2.伴隨診斷: 許多新藥開發與分子標誌物相連結,基因檢測結果直接決定治療選項。
3.研究與臨床試驗入選: 檢測結果可幫助評估患者是否符合特定臨床試驗的入組標準。

 

總結: 採用 NGS 77基因癌症檢測的原因:
✅ 涵蓋多種臨床重要突變
✅ 指引標靶與免疫治療
✅ 預後及復發監測
✅ 高效、靈敏、低檢體需求
✅ 符合個人化、精準醫療發展

 

分析方法:

1.循環腫瘤細胞檢測(CTC),核酸基因組放大(WGA)之核酸檢體。
2.以Roche之AVENIO Target Panel進行基因片段的擴增和建庫後,
3.以illumina公司的次世代定序分析儀進行序列定序,
4.所得之序列再利用羅氏Roche Oncology Analysis Software進行變異點分析,
5同時也使用大安聯合生物資訊平台或羅氏NAVIFY Mutation Profiler,Roche比對已核淮使用或臨床試驗中的基因突變對應之適應症、癌症等資訊

 

檢測標的基因:ABL1, AKT1, AKT2, ALK, APC, AR, ARAF, BRAF, BRCA1, BRCA2, CCND1, CCND2, CCND3, CD274, CDK4, CDK6, CDKN2A, CSF1R,CTNNB1, DDR2, DPYD, EGFR, ERBB2, ESR1, EZH2, FBXW7, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FLT1, FLT3, FLT4, GATA3, GNA11, GNAQ, GNAS, IDH1, IDH2, JAK2, JAK3, KDR, KEAP1, KIT, KRAS, MAP2K1, MAP2K2, MET, MLH1, MSH2, MSH6, MTOR, NF2, NFE2L2, NRAS, NTRK1, PDCD1LG2, PDGFRA, PDGFRB, PIK3CA, PIK3R1, PMS2, PTCH1, PTEN, RAF1, RB1, RET, RNF43, ROS1, SMAD4, SMO, STK11, TERT, TP53, TSC1, TSC2, UGT1A1及VHL等

符合美國National Comprehensive Cancer Network® (NCCN®)指引。

 

 

臨床意義:

本檢測為分析福馬林固定石蠟包埋組織或全血游離的DNA是否帶有77個特定基因的突變點,包含四種主要的突變類型:

1.單核苷酸變異 (single nucleotide variations, SNVs)
2.插入或缺失 (Insertion and deletion, Indels)
3.拷貝數變異 (Copy number variations, CNVs)
4.基因融合 (fusion)

品質良好的檢體各突變類型的靈敏度、特異性及再現性都可以達到99%以上。

 

檢測流程:

1.與醫師或專業諮詢師溝通
2.填寫同意書採集 2~3ml周邊血或石蠟包埋的組織玻片或蠟卷檢體
3.萃取全基因體DNA
4.針對特定基因進行次世代核酸定序 (NGS)及結果分析
5.專業醫師簽核、報告發送,10個工作天

 

健康照護:

本檢測以提供臨床醫師用藥建議為目的,對於尚無用藥資訊之基因變異則不會納入報告中;而隨著臨床研究及應用的不斷更新,不排除未來將更新基因突變、用藥資訊及臨床解釋,受檢者仍需配合醫師的指示,進行合適的治療。

 

注意事項:

本檢驗所採用的檢驗方法可能無法檢出較為罕見的基因變異型別,靈敏度並非100%。若有任何異常結果或對報告有疑問,都應諮詢專科醫師或是遺傳諮詢師。

 

參考資料:

1.           大安聯合:次世代定序癌症77基因檢測

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